Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии имени великого французского вирусолога и эпидемиолога Луи Пастера разработал тест-систему для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 в клиническом материале методом одностадийной ОТ-ПЦР. Новый диагностический набор получил название “COVID-19 AMP”. Получена вся необходимая разрешительная документация для новой тест-системы для ПЦР-диагностики коронавируса COVID-19, тест-система запатентована, Росздравнадзор уже зарегистрировал изобретение.
Не секрет, что тесты, которые используются в настоящий момент, слишком часто дают статистическую погрешность. Это и понятно, ведь разрабатывались они «на скорую руку» в момент неожиданно нагрянувшей пандемии, когда у научного сообщества информации о новом коронавирусе было недостаточно. Приходилось действовать быстро и разрабатывать тест-системы «на первое время». Из-за этого пациентам с подозрением на коронавирус приходится проводить несколько исследований. Все это дорого обходится, как в прямом финансовом смысле, так и по времени, ведь каждый день и час порою на счету.
В начале апреля 2020 Департамент здравоохранения Москвы признал низкую точность тестов на COVID-19, подчеркнув, что, к сожалению, пока единственным достоверным подтверждением заболевания остается компьютерная томография (КТ) легких. Однако метод КТ обладает крайне низкой специфичностью.
В мае 2020 Федерация лабораторной медицины (ФЛМ) озаботилась точностью используемых в России тест-систем для диагностики новой коронавирусной инфекции. Производителям было предложено подвергнуть их наборы реагентов внешнему аудиту. ФЛМ решила провести собственный анализ специфичности и чувствительности тест-систем, применяемых для диагностики SARS-CoV-2 методом ПЦР в России. С таким запросом в Федерацию обратились региональные лаборатории. В ФЛМ пояснили, что не преследуют цель дискредитировать отдельных производителей тест-систем. Основную задачу профессиональное сообщество видит в информировании медицинских работников о возможностях и ограничениях лабораторной диагностики COVID-19.
Новейшая тест-система COVID-19 AMP разработана лучшими учеными-вирусологами и эпидемиологами уже с учетом недостатков и ошибок всех тест-систем, имеющихся на данный момент в России, обладает реально высокой диагностической чувствительностью и специфичностью, и позволяет контролировать все этапы проведения анализа.
Тест-систему разработали сотрудники группы молекулярной генетики патогенных микроорганизмов Института им. Пастера при участии Отдела новых технологий НИИ. По словам заместителя директора по научной работе Института Владимира Дедкова, «наличие контрольных образцов позволяет контролировать все этапы, и тот результат, который мы получаем, обладает большой долей достоверности». Следует отметить, что в разработанной COVID-19 AMP тест-системе ПКО (положительный контрольный образец) представляет собой взвесь псевдовирусных частиц на основе фага MS2, содержащих фрагмент РНК SARS-CoV-2, амплифицируемый в реакции ОТ-ПЦР. ВКО представляет собой взвесь псевдовирусных частиц на основе фага MS2, содержащих нуклеотидную последовательность артифициальной РНК, амплифицируемую в реакции ОТ-ПЦР с участием праймеров к ВКО и детектируемую с участием зондов к ВКО. То есть для создания положительного контрольного образца (ПКО) и внутреннего контрольного образца (ВКО) использовали технологию получения армированных (защищенных) РНК на основе пакующей системы РНК-содержащего фага MS2. Полученный по этой технологии контрольный образец устойчив к РНКазам, стабилен, неинфекционен для людей и проходит все те же стадии, что и исследуемые образцы. Это, безусловно, одно из ярких достоинств новой тест-системы, в то время как почти половина (!) тест-систем, зарегистрированных в России, вообще не имеют ВКО в своем составе, а большинство других используют в качестве ВКО незащищенную, то есть нестабильную РНК.
Использование внутреннего контроля необходимо для исключения ошибок, приводящих к ложноотрицательным результатам при диагностике, и чем лучше ВКО и ПКО, тем точнее и достовернее результат теста.
Тестирование с помощью нового диагностикума COVID-19 AMP позволит избежать ложноположительных и ложноотрицательных результатов и составить полную клиническую картину.
